新型コロナウイルス(COVID-19)の重症化リスクは遺伝的要素に大きく左右される？！

赤羽(Akabane)

今回は「新型コロナの重症化にはある遺伝的要素が大きく関係しているかも」というお話です。

新型コロナウイルス(COVID-19)の重症化リスクは遺伝的要素に大きく左右される？！

2020年10月現在では、新型コロナウイルス(COVID-19)が重症化する人の共通点として、高齢者や喫煙歴、基礎疾患持ちなどが挙げられています。

しかし、こうした因子だけではどうにも説明がつかない部分もあったようで、今回のデータではこの疑問にアプローチしています。

新型コロナが重症化するかどうかは祖先から受け継いだ遺伝子がカギを握っているみたいだ

2020年にマックス・プランク進化人類学研究所が発表した研究(#1)によると、COVID-19の重症化にはネアンデルタール人から受け継いだ遺伝子が影響している可能性があることが判明しました。

この研究は、同年にCOVID-19の研究チームによって発表された研究(#2)で分かった知見をベースにしていまして、新型コロナの重症化には以下の遺伝子領域が影響しているというものです。

6つの遺伝子を含む3番染色体
ABO式血液型を決定する9番染色体

これを踏まえて、当研究チームは、中でも3番染色体の遺伝子の起源は4〜6万年前のネアンデルタール人かデニソワ人であるとし、今日人類が持つ染色体はどちらから受け継いだものなのか？をゲノムワイド関連分析で調べたようです。

果たして分析の結果は、以下のようになりました。

結果

今日の3番染色体は、南ヨーロッパ・クロアチア由来のネアンデルタール人のものとほぼマッチしていた
一方で、シベリア由来のネアンデルタール人やデニソワ人のものとはマッチしなかった
またこうした遺伝的特徴がネアンデルタール人と現代人の両方に共通の祖先から受け継がれたものである可能性を確かめたところ、およそ5万年前に起こった南欧のネアンデルタール人との交配によって引き継がれてきた可能性が高いことが分かった

結論、今日新型コロナの重症化に関係しているとされる染色体はネアンデルタール人から受け継いだもので、特に南欧のネアンデルタール人に因るものだった可能性が高い！と。

3つ目の知見に関しては、ネアンデルタール人と現代人とではバリアント(遺伝子型の様々な型を総称したもの)が長い遺伝子領域に渡って似ていることが判明しまして、もし仮にネアンデルタール人以前の共通の祖先から受け継がれた遺伝子だった場合、ネアンデルタール人と人類の祖先との交配があれば遺伝子組み換えが起こってしまい、これ程までに似ることはなかったと考えられております。

重症化に関わる遺伝子の現代における分布はどうなっている？

更に、こうした染色体が現代においてどのように分布しているか？を遺伝子データから解析してくれていまして、そこからこんなことも分かりました。

バングラデシュで最も多く見られ、人口の63%が少なくともこの染色体のうち1つのタイプを持ちあわせている
南アジア地域では30%、ヨーロッパでは8%、白人以外の人種をルーツに持つアメリカ人で4%、東アジアではそれ以下の割合だった
アフリカの地域にはほとんど存在しなかった

また、バングラデシュ人をルーツに持つイギリス人は、そうでない場合よりもCOVID-19によって死亡するリスクが2倍近く高かったというデータもありまして、より一層信憑性が高い知見だと言えます。

こうした結果を踏まえると、日本で割りかし重症患者が出にくいのには、遺伝の側面も少なからず影響しているのかもしれません。

まとめ

では最後に今回のまとめを見ていきましょう。

ポイント

COVID-19の重症化にはネアンデルタール人から受け継いだ遺伝子が影響している可能性があると判明
ゲノムワイド解析などの結果から、現在この遺伝子を多く受け継いでいるのはバングラデシュをはじめ南アジアの人々であることが分かり、一方でアフリカではほとんどこの遺伝子が見つからず、東アジアやヨーロッパなどの地域でも割りかし少なかった
更に別の解析では、ネアンデルタール人と現代人の両方に共通の祖先から受け継いだ遺伝子である可能性も検証しており、改めて、新型コロナ重篤化に関わる遺伝子は南欧由来のネアンデルタール人から引き継がれたものである信憑性が裏付けられた

赤羽(Akabane)

兼ねてから、高齢者や基礎疾患持ちであっても重症化しない人が一定数居たことから、何か他の要因があるのではないか？と考えられていましたが、どうやら遺伝的要素の影響も少なからずありそうですね。今回ターゲットになったもの以外で他の遺伝的な影響はないのか、この点は今後の追試に期待です。

参考文献&引用

#1 Zeberg, H., Pääbo, S. The major genetic risk factor for severe COVID-19 is inherited from Neanderthals. Nature (2020). https://doi.org/10.1038/s41586-020-2818-3

#2 Ellinghaus D, Degenhardt F, Bujanda L, et al. Severe Covid-19 GWAS Group. Genomewide Association Study of Severe Covid-19 with Respiratory Failure. N Engl J Med. 2020 Jun 17:NEJMoa2020283. doi: 10.1056/NEJMoa2020283. Epub ahead of print. PMID: 32558485; PMCID: PMC7315890.